En Sonic the Hedgehog 3, Sonic y sus amigos, Tails y Knuckles, se embarcan en una nueva y peligrosa aventura cuando el Dr. Robotnik (Jim Carrey) regresa con un plan mรกs siniestro que nunca. Esta vez, las ambiciones de Robotnik van mรกs allรก de conquistar la Tierra; busca aprovechar la energรญa de un misterioso fenรณmeno cรณsmico capaz de alterar la estructura del universo.
Junto a Robotnik estรก Shadow the Hedgehog, un formidable rival con habilidades superiores y una misteriosa conexiรณn con los orรญgenes de Sonic. Mientras Sonic se enfrenta a Shadow, tambiรฉn debe demostrar que el poder de la amistad y la confianza pueden superar cualquier obstรกculo.